Laboratório de Bioquímica e Biologia Molecular de Microorganismos

ALINE MARIA DA SILVA
Professora Associada
Departamento de Bioquímica
Instituto de Química - USP
Bloco 12 inf. - sala 1224
Email: almsilva@iq.usp.br
tel:  5511 30912182
5511 30913815 ramais 225/228
fax:  5511 38155579

Nosso grupo de pesquisa desenvolve duas linhas de pesquisa principais. A primeira investiga diferentes aspectos da fosforilação reversível de proteínas, através da caracterização molecular das proteínas fosfatases (PPs). Estas enzimas são responsáveis pela desfosforilação de resíduos de fosfoserina ou fosfotreonina e componente importantes nas vias de sinalização celular.  Muitas das proteínas fosfatases existem como complexos constituídos de uma subunidade catalítica e de subunidades regulatórias. A diversidade funcional das PPs é atribuída às distintas subunidades regulatórias que compõem a holoenzima conferindo especificidade e/ou modulando a atividade da subunidade catalítica. Temos como objetivo caracterizar proteínas que interagem com subunidades catalíticas das PPs que identificamos nos microorganismos eucarióticos Dictyostelium discoideum e em Neurospora crassa. A função biológica destes complexos enzimáticos é investigada através de técnicas de genética molecular como por exemplo inativação ou superexpressão de genes nestes microorganismos que são de fácil manipulação no laboratório.

A segunda linha consiste na análise do transcritoma de organismos, tecidos e células submetidos a diferentes situações fisiológicas ou patológicas utilizando a tecnologia de microarrays de DNA em lâminas de vidro (chips de DNA) e ferramentas de bioinformática adequadas para identificação e anotação de genes expressos. Estamos investigando expressão gênica global da bactéria Xylella fastidiosa submetida a diferentes situações fisiológicas e também comparando a expressão gênica de diferentes cepas deste fitopatógeno. A expressão de um conjunto de genes que participam em vias de sinalização celular também está sendo analisada em variedades distintas da cana de açúcar submetidas a diferentes condições de cultivo. A  expectativa é que estes estudos permitam a identificação de genes relacionados aos mecanismos de patogenicidade da Xylella fastidiosa e de genes que possam ser manipulados visando o melhoramento genético da cana de açúcar.