ALINE MARIA DA SILVA
Professora Associada
Departamento de Bioquímica
Instituto de Química
- USP
Bloco 12 inf. - sala
1224
Email: almsilva@iq.usp.br
tel: 5511 30912182
5511 30913815 ramais
225/228
fax: 5511 38155579
Nosso grupo de pesquisa desenvolve duas linhas de pesquisa principais. A primeira investiga diferentes aspectos da fosforilação reversível de proteínas, através da caracterização molecular das proteínas fosfatases (PPs). Estas enzimas são responsáveis pela desfosforilação de resíduos de fosfoserina ou fosfotreonina e componente importantes nas vias de sinalização celular. Muitas das proteínas fosfatases existem como complexos constituídos de uma subunidade catalítica e de subunidades regulatórias. A diversidade funcional das PPs é atribuída às distintas subunidades regulatórias que compõem a holoenzima conferindo especificidade e/ou modulando a atividade da subunidade catalítica. Temos como objetivo caracterizar proteínas que interagem com subunidades catalíticas das PPs que identificamos nos microorganismos eucarióticos Dictyostelium discoideum e em Neurospora crassa. A função biológica destes complexos enzimáticos é investigada através de técnicas de genética molecular como por exemplo inativação ou superexpressão de genes nestes microorganismos que são de fácil manipulação no laboratório.
A segunda linha consiste
na análise do transcritoma de organismos, tecidos e células
submetidos a diferentes situações fisiológicas ou
patológicas utilizando a tecnologia de microarrays de DNA em lâminas
de vidro (chips de DNA) e ferramentas de bioinformática adequadas
para identificação e anotação de genes expressos.
Estamos investigando expressão gênica global da bactéria
Xylella fastidiosa submetida a diferentes situações fisiológicas
e também comparando a expressão gênica de diferentes
cepas deste fitopatógeno. A expressão de um conjunto de genes
que participam em vias de sinalização celular também
está sendo analisada em variedades distintas da cana de açúcar
submetidas a diferentes condições de cultivo. A expectativa
é que estes estudos permitam a identificação de genes
relacionados aos mecanismos de patogenicidade da Xylella fastidiosa
e de genes que possam ser manipulados visando o melhoramento genético
da cana de açúcar.