cv

SHAKER CHUCK FARAH

tel. do trabalho: 3091-3312 ext 104
FAX: 3815-5579
e-mail: chsfarah@.iq.usp.br

Data de nascimento: 08 de março, 1962
Nacionalidade: Canadense, Residente Permanente no Brasil

CARGO: Professor Associado
Departamento de Bioquímica
Instituto de Química, Universidade de São Paulo
Av. Prof. Lineu Prestes 748, Bloco de Química Fina, Sala 10/12

Contratado: 14 de fevereiro de 1996
Livre Docente: dezembro de 2002

EDUCAÇÃO

1981-85: Bacharel em Ciências
Química e Bioquímica
University of Toronto

1988-89: Bacharel em Educação
Faculty of Education
University of Toronto

1985-1988 Mestre em Ciências
Department of Biochemistry, University of Toronto
Sob a orientação do Prof. Dr. David E. Pulleyblank
Título da Tese: Polypurine/Polypyrimidine DNA Structutes: Unusual DNA
Conformations Induced by Superhelical Torsion and Low pH

1990-1994 Doutorado em Bioquímica
Instituto de Química, Universidade de São Paulo
Sob a orientação do Prof. Dr. Fernando de Castro Reinach
Título da Tese: Funções Estruturais e Regulatórias das
Regiões NH2- e COOH-terminal da Troponina I

1994-1995 Pós Doutorado em Bioquímica
Instituto de Química, Universidade de São Paulo
Sob a orientação do Prof. Dr. Fernando de Castro Reinach
Título do Projeto: Espressão da Miosina Muscular
Recombinante em E. coli

PUBLICAÇÕES CIENTÍFICAS

37) Guzzo, C.R., Nagem, R.A.P., Barbosa, J.A.R.G., and Farah, C.S. (2007) The structure of Xanthomonas axonopodis pv. citri YaeQ reveals new compact protein fold built around a variation of the PD-(D/E)XK nuclease motif. Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics, in press.

36) Cicero, D.O., Contessa, G.C., Pertinhez, T.A., Gallo, M., Katsuyama, A.M., Paci, M., Farah, C.S., and Spisni, A. (2007) The Solution Structure of ApaG from Xanthomonas axonopodis pv. citri reveals a Fibronectin-3 Fold. Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics 67, 490-500.

35) Corrêa, F. and Farah, C.S (2007) Trifluoroethanol stabilizes alpha-tropomyosin helices but destabilizes the head-to-tail complex. Biophysical Journal 92, 2463-2475.

34) Khater, L., Alegria, M.C., Santos, T.M., Docena, C., Tasic, L., Farah, C.S. and Ramos C.H.I. (2007) Identification of the flagellar chaperone FlgN in the phytopathogen Xanthomonas axonopodis pathovar citri and characterization of its interaction with hook-associated FlgK. Arquives of Microbiology, in press.

33) Andrade, M.O., Alegria, M.C., Guzzo, C.R., Docena, C., Rosa, M.C.P., Ramos, C.H.I. and Farah, C.S. (2006) The HD-GYP domain of RpfG mediates a direct linkage between the Rpf Quorum sensing pathway and a subset of diguanylate cyclase proteins in the phytopathogen Xanthomonas axonopodis pv citri. Molecular Microbiology 62, 537–551

32) Guzzo, C.R., Silva, L.R., Galvao-Botton, L.M.P., Barbosa, J.A.R.G. and Farah, C.S. (2006) Expression, crystallization and preliminary crystallographic analysis of SufE (XAC2355) from Xanthomonas axonopodis pv. citri. Acta Crystallographica Section F. 62, 268-270.

31) Barbosa, J.A.R.G., Netto, L.E.S., Farah, C.S., Schenkman, S. and Meneghini, R. (2006) The structural molecular biology network of the state of São Paulo, Brazil. Anais da Academia Brasileira de Ciências (Annals of the Brazilian Academy of Sciences) 78, 241-254.

30) Guzzo, C.R., Nagem, R.A.P., Galvão-Botton, L.M.P, Guimarães, B.G., Medrano, F.J., Barbosa, J.A.R.G. and Farah, C.S. (2005) Expression, purification, crystallization and preliminary X-ray analysis of YaeQ (XAC2396) from Xanthomonas axonopodis pv citri. Acta Crystallographica Section F 61, 493-495.

29) Alegria, M.C., Souza, D. P., Andrade, M.O., Docena, C., Khater, L., Ramos, C.H.I., da Silva, A.C.R., Farah, C.S. (2005) Identification of new protein-protein interactions involving the products of the chromosome - and plasmid – encoded type IV secretion loci of the phytopathogen Xanthomonas axonopodis pv. citri. J. Bacteriology, 187, 2315-2325.

28) Corrêa, F. and Farah, C.S. (2005) Using 5-hydroxytryptophan as a probe to follow protein-protein interactions and protein folding transitions. Protein and Peptide Letters 12, 241-244.

27) Tiroli A.O, Tasic, L., Oliveira, C.L.P., Bloch, C. Torriani, I, Farah, C.S., and Ramos, C.H.I. (2005) Identification of the contacts in the regulatory subunit of TnC-TnI by analyses of single-chain chimeras, Eur. J. Biochem/FEBS Journal 272, 779–790.

26) Alegria, M.C., Docena, C., Khater, L., Ramos, C.H.I., da Silva, A.C.R., Farah, C.S. (2004) New protein-protein interactions identified for the regulatory and structural components and substrates of the type III secretion system of the phytopathogen Xanthomonas axonopodis pv citri. J. Bacteriology 186, 6186-6197.

25) Holthauzen, L.M.F. Corrêa, F and Farah, C.S. (2004) Ca2+-induced rolling of tropomyosin in muscle thin filaments: the ?- and ?-band concept revisited. J. Biol. Chem. 279, 15204-15213.

24) Katsuyama, A.M., Cicero, D.O., Spisni , A., Paci, M., Farah, C.S. and Pertinhez, T.A. (2004) 1H, 15N and 13C resonance assignments of the ApaG protein of the phytopathogen Xanthomonas axonopodis pv. citri. Journal of Biomolecular NMR, 29, 423-424.

23) Paulucci, A.A., Katsuyama, A.M., Sousa, A.D. and Farah, C.S. (2004) A specific C-terminal deletion in tropomyosin results in a stronger head to tail interaction and increased polymerization. European Journal of Biochemistry 271, 589-600.

22) Galvão-Botton, L.M.P., Katsuyama, A.M., Guzzo, C.R., Almeida, F.C.L., Farah, C.S. and Valente, A.P. (2003) High-throughput Screening of Structural Proteomics Targets Using NMR FEBS Letters 552, 207-213.

21) Valencia, F.F., Paulucci, A.A., Quaggio, R.B. Da Silva, A.C.R., Farah, C.S. and Reinach, F.C. (2003) Parallel measurement of Ca2+-binding and fluorescence emission upon Ca2+ titration of recombinant skeletal muscle troponin C: Measurement of sequential calcium binding to the regulatory sites J. Biol. Chem. 278, 11007-11014.

20) Junqueira de Azevedo, I.L.M, Pertinhez, T., Spisni, A., Carreño, F.R., Farah, C.S., and Ho, P.L. (2003) Cloning and expression of a new EF-hand protein from the venom glands of Bothrops insularis snake in E. coli. Biochimica et Biophysica Acta 1648, 90-98.

19) Paulucci, A.A. Hicks, L., Machado, A., Miranda, M.T. M., Kay C.M. and Farah, C.S. (2002) Specific sequences determine the stability and cooperativity of folding of the C-terminal half of tropomyosin. J. Biol. Chem. 277, 39574-39584.

18) Sousa, A.D. and Farah, C.S. (2002) Quantitative analysis of tropomyosin linear polymerization equilibrium as a function of ionic strength J. Biol. Chem. 277, 2081-2088.

17) da Silva, A.C.R., Ferro, J.A., Reinach, F.C., Farah, C.S. et al. (2002) Complete genome sequences of two Xanthomonas pathogens with similar genomes but different host specificities Nature 417, 459-463.

16) Reis, E.S., Baracho, G.V. Lima, A.S., Farah, C.S. and Isaac, L. (2002) Homozygous hereditary C3 deficiency due to a stop codon Journal of Clinical Immunology 22, 321-330

15) Ngai, S.-M., Pearlstone, J.R., Farah, C.S., Reinach, F.C., Smillie, L.B.
and Hodges, R.S. (2002) Structural and Functional Studies on Troponin I and
Troponin C Interactions (vol 83, pg 33-46, 2001), J. Cellular Biochem. 84, 847

14) Oliveira, D.M., Nakaie, C.R., Sousa, A.D., Farah, C.S. and Reinach, F.C. (2000) Mapping the Activation Domain of Troponin T Responsible for Activation of Actomyosin ATPase Activity: Identification of Residues Involved in Binding to Actin J. Biol. Chem. 275, 27513-27519.

13) Farah, C.S. and Reinach, F.C. (1999) Regulatory Properties of Recombinant Tropomyosins Containing 5-Hydroxytryptophan: Ca2+-binding to troponin results in a conformational change in a region of tropomyosin outside the troponin binding site. Biochemistry 38, 10543-10551.

12) Das, K., Ashby, K.D., Smirnov, A.V., Reinach, F.C., Petrich, J.W., and Farah, C.S. (1999) Fluorescence Properties of Recombinant Tropomyosin Containing Tryptophan, 5-Hydroxytryptophan and 7-Azatryptophan Photochem. Photobiol. 70, 719-730.

11) Malnic, B., Farah, C.S. and Reinach, F.C. (1998) Regulatory Properties of the NH2- and COOH-terminal domains of Troponin T: ATPase activation and binding to TnI and TnC J. Biol. Chem. 273, 10594 10601.

10) Isaac, L. and Farah, C.S. (1998) A Combined PCR-Gapped Duplex Method for Site-directed Mutagenesis BioTechniques 25, 758-759.

9) Isaac, L., Aivazian, D., Taniguchi-Sidle, A., Ebanks, R.O., Farah, C.S., Florido, M.P.C., Pangburn, M.K. and Isenman, D.E. (1998) Native Conformations of Human Complement Components C3 and C4 Show Different Dependencies on Thioester Formation Biochem. J. 329, 705 712.

8) Van Eyk JE, Thomas LT, Tripet B, Wiesner RJ, Pearlstone JR, Farah CS, Reinach FC, Hodges RS (1997) Distinct regions of troponin I regulate Ca2+ dependent activation and Ca2+-sensitivity of the acto S1 TM ATPase activity of the thin filament. J. Biol. Chem. 272, 10529 10537.

7) Reinach, F.C., Farah, C.S., Monteiro, P.B., and Malnic, B. (1997) Structural Interactions Responsible for the Assembly of the Troponin Complex on the Muscle Thin Filament Cell Structure and Function 22, 219-223.

6) Capurro, M.L., Marinotti, O., Farah, C.S., James, A.A. and Bianchi, A.G. (1997) The Nonvitellogenic Female Protein of Musca domestica is an Adult-Specific Hexamerin Insect Molecular Biology 6, 97-104.

5) Farah, C.S. and Reinach, F.C. (1995) The Troponin Complex and Regulation of Muscle Contraction, FASEB J. 9, 755-767.

4) Farah, C.S., Miyamoto, C.A., Ramos, C.H.I., da Silva, A.C.R., Quaggio, R.B., Fujimori, K., Smillie, L.B., and Reinach, F.C. (1994) The Structural and Regulatory Functions of the NH2 and COOH terminal Regions of Skeletal Muscle Troponin I, J. Biol. Chem. 269, 5230 5240.

3) Glover, J.N.M., Farah, C.S., and Pulleyblank, D.E. (1990) The Separation and Structural
Characterization of H DNA Conformers, Biochemistry 29, 11110 11115.

2) Pulleyblank, D.E., Glover, J.N.M., Farah, C.S., and Haniford, D.B. (1988) The Specificity of 'Single Strand Specific' Endonucleases: Probes of Phosphodiester Conformation in Double Stranded Nucleic Acids, in Unusual DNA Structures, Eds R.D. Wells and R.D.Hanvey (Springer Verlag), pp. 23 44.

1) Pulleyblank, D.E., Glover, J.M.M., Farah, C.S. and Haniford, D.B. (1987) Intermediate Range Transmission of Conformational Information in DNA, in Structure and Expression (Vol. 2): DNA and its Drug Complexes, Eds. R.H. Sarma and M.H. Sarma (Adenine Press), pp. 95 104.

PARTICIPAÇÃO EM CONGRESSOS CIENTÍFICOS E OUTROS FÓRUNS CIENTÍFICOS

Apresentações Orais

15) Farah, C.S. (2007) Protein-Protein Interaction Network of the Quorum Sensing Response in Xanthomonas axonopodis pv. citri XXVI Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular e 10th IUBMB Conference: “Infectious Diseases: Biochemistry of Parasites Vectors and Hosts”, Salvador, BA, 21-25 de maio. Apresentação oral.

14) Farah, C.S. (2005) Genoma funcional de Xanthomonas axonopodis pv. citri Sociedade Brasileira de Genética, Águas de Lindoia, 25 de agosto, 2005. Águas de Lindoia, 7-10 de setembro, 2005. Apresentação oral.

13) Guzzo, C.R., Nagem, R.A.P., Barbosa, J.A.R.G. and Farah, C.S. (2005) The Crystal Structures of two proteins from Xanthomonas axonopodis pv citri: YaeQ (XAC2396) and SufE (XAC2355). Federação das Sociedades de Biologia Experimental (XX FESBE), Águas de Lindoia, 25 de agosto, 2005. Apresentação oral.

12) Guzzo, C.R., Nagem, R.A.P., Galvão-Botton, L.M.P, Guimarães, B.G., Medrano, F.J., Barbosa, J.A.R.G. and Farah, C.S. (2005) The Crystal Structure of YaeQ from Xanthomonas axonopodis pv citri. Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, Águas de Lindoia, SP 02-07 Julho, 2005. Apresentação oral.

11) Farah, C.S. (2004) Protein – Protein Interactions Involving Components of the Type III and type IV Secretion and the Quorum Sensing Systems of Xanthomonas axonopodis pv citri. 1st Latin American Protein Society Meeting, 8-12 de novembro de 2004, Angra dos Reis, Brasil. Apresentação oral.

10) Farah, C.S. (2004) Using 5-hydroxytryptophan as a probe to follow protein - protein interactions and protein folding transitions. Federação das Sociedades de Biologia Experimental (XIX FESBE), 25-28 de Agosto, 2004, Águas de Lindóia, SP. Apresentação oral.

9) Farah, C.S. (2004) NMR 3D Structure Determination Of ApaG/CorD Protein of the Phytopathogen Xanthomonas axonopodis pv. citri Oficina De Ressonância Magnética Nuclear Em Biologia - evento paralelo à XIV Reunião Anual de Utilitários do Laboratório Nacional de Luz Síncrotron, 11/02/04, Campinas, SP. Apresentação oral

8) Farah, C.S. (2003) Identification and Structure-Function Analysis of Protein-Protein Interactions in the plant pathogen Xanthomonas axonopodis pv citri Coordenador da mesa redonda e apresentação oral no XXXII Reunião Anual de SBBq, Caxambu, M.G., Brasil.

7) Farah, C.S. (2002) Evidência direita para rolamento (“rolling”) da tropomiosina em resposta ao Ca2+ no filamento fino regulado: Retorno à hipótese das bandas alfa/beta Palestra Apresentado no 21 de junho para o Departamento de Bioquímica Médica - ICB, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, R.J.

6) Farah, C.S. (2002) Estudos Estrutura-Função sobre Tropomiosina e seu Papel na Regulação da Contração Muscular Palestra apresentado no 08 de fevereiro para o Faculdade de Medicina de Riberão Preto da Universidade de São Paulo, Riberão Preto, SP.

5) Farah, C.S. (2002) Coordenador da Mesa Redonda sobre “Biologia Estrutural” na XXIX Reunião Anual de SBBq, Caxambu, M.G., Brasil, maio 2002.

4) Farah, C.S. (1998) Regulação de Contração Muscular pela Troponina-Tropomiosina. Palestra Apresentado para o Departamento de Bioquímica Médica - ICB, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, R.J.

3) Farah, C.S and Reinach, F.C. (1996) Studies on the Regulation of Muscle Contraction by Troponin-Tropomyosin, XXV Reunião Anual de SBBq, Caxambu, M.G., Brasil - apresentação oral

2) Farah, C.S. and Reinach, F.C. (1993) Mutantes de Troponina I Palestra Apresentada para o Departamento de Bioquímica do Instituto de Química, USP, São Paulo

1) Farah, C.S and Reinach, F.C. (entre Natal e Ano novo de 1992) Deletion Mutants of Troponin I. Palestra apresentada para o Department of Biochemistry, MRC Group on Protein Structure and Function, University of Alberta, Edmonton, Canadá.

Apresentações Orais dos Alunos do Nosso Laboratório

5) Andrade, M.O (2007) O processo de quorum-sensing em Xanthomonas Departamento de Bioquímica, IQ-USP - 14 de junho, Apresentação Oral de Maxuel O. Andrade (aluno DR).

4) Andrade, M.O., Alegria, M.C and Farah, C.S. (2005) Characterization of protein-protein interactions important for the regulation of the quorum-sensing process in Xanthomonas axonopodis pv. citri. XXXIV Reunião Anual de SBBq, 2-5 Julho, Águas de Lindoia, SP, Brasil. Apresentação Oral do Maxuel O. Andrade (aluno MS).

3) Corrêa, F., and Farah, C.S. (2005) An analysis of the Head-to-Tail interaction of Tropomyosin by thermodynamic cycles. XXXIV Reunião Anual de SBBq, 2-5 Julho, Águas de Lindoia, SP, Brasil. Apresentação Oral do Fernando Corrêa (aluno DR).

2) Guzzo, C.R., Nagem, R.A.P., Galvão-Botton, L.M.P, Guimarães, B.G., Medrano, F.J., Barbosa, J.A.R.G. and Farah, C.S. (2005) The Crystal Structure of YaeQ from Xanthomonas axonopodis pv citri. Sociedade Brasileiro de Cristalografia, LNLS, Campinas, SP, 23-25 fevereiro 2005. Apresentação oral da Cristiane Guzzo (aluna DR).

1) Paulucci, A.P. (2003) Fragmentos de tropomiosina: estudos da estabilidade da estrutura "coiled-coil" e das interações cabeça-cauda. Departamento de Bioquímica, IQ-USP, 15 maio 2003. Apresentação oral da Adriana A. Paulucci (aluna DR)

Apresentação de pôsteres

71) Corrêa, F., Salinas, R. K., Bonvin, A. M. J. J., and Farah, C. S. (2007) Structural and stability analysis of the skeletal a-tropomyosin head-to-tail complex. Biophysical Society, 51st Annual Meeting, EUA. Biophysical Journal.

70) Andrade, M.O., Alegria, M.C.; Guzzo, C.R.; Farah, C.S. (2007) The HD-GYP Domain of RpfG Mediates a Direct Linkage Between the Rpf Quorum-Sensing Pathway and a Subset of Diguanylate Cyclase Proteins in the Phytopathogen Xanthomonas axonopodis pv. citri. XXXVI Reunião Anual de SBBq e 10th IUBMB Conference, 21-25 de maio, Salvador, BA, Brasil.

69) Guzzo, C.R., Silva, L.R., Galvão de Botton, L.M.P, Barbosa, J.A.R.G., Farah, C.S. (2007) Crystal Structure of SufE from Xanthomonas axonopodis pv. citri XXXVI Reunião Anual de SBBq e 10th IUBMB Conference, 21-25 de maio, Salvador, BA, Brasil.

68) Guzzo, C.R., Nagem, R.A.P., Barbosa, J.A.R.G., Farah, C.S. (2007) The Structure of Xanthomonas Axonopodis pv. citri YaeQ Reveals a New Compact Protein Fold Built Around a Variation of the PD-(D/E)XK Nuclease Motif XXXVI Reunião Anual de SBBq e 10th IUBMB Conference, 21-25 de maio, Salvador, BA, Brasil.

67) Rosa, M.C.P. and Farah, C.S. (2007) Investigating the Signal Transduction and Gene Expression Networks Responsible for the Expression of the Type III Secretion System in Xanthomonas axonopodis pv. citri XXXVI Reunião Anual de SBBq e 10th IUBMB Conference, 21-25 de maio, Salvador, BA, Brasil.

66) Cappelletti, P.A. and Farah, C.S. (2007) The HrpB2 - HrcU Interaction in the Context of Type III Secretion and Pathogenesis in Xanthomonas axonopodis pathovar citri XXXVI Reunião Anual de SBBq e 10th IUBMB Conference, 21-25 de maio, Salvador, BA, Brasil.

65) Souza, D.P., Salinas, R.K., Farah, C.S. (2007) Characterization of the VirB7-VirB9 Interaction and Initial NMR Structure Determination of VirB7 from Xanthomonas axonopodis pv citri Chromosomal Type IV Secretion System XXXVI Reunião Anual de SBBq e 10th IUBMB Conference, 21-25 de maio, Salvador, BA, Brasil.

64) Souza, D.P., Salinas, R.K., Farah, C.S. (2007) NMR Studies on the Structure of the C-Terminal Domain from a Multiprotein Bridging Factor (Trmbf1) From Trichoderma reesei XXXVI Reunião Anual de SBBq e 10th IUBMB Conference, 21-25 de maio, Salvador, BA, Brasil.

63) Souza, T.A., Cernadas, R.A., Docena, C., Farah, C.S., Benedetti, C.E. (2007) Analysis of the PthA2 Interactions with Citrus Proteins Involved in Transcriptional Control XXXVI Reunião Anual de SBBq e 10th IUBMB Conference, 21-25 de maio, Salvador, BA, Brasil.

62) Docena, C., Alegria, M.C., Cappelletti, P.A., Rosa, M.C.P., Farah, C.S. (2007) Identifying Protein-Protein Interactions of Two-Component Systems of the Phythopathogen Xanthomonas axonopodis pv. citri XXXVI Reunião Anual de SBBq e 10th IUBMB Conference, 21-25 de maio, Salvador, BA, Brasil.

61) Guzzo, C.R. ; Nagem R.A.P; Galvão-Botton, L.M.P.; Guimarães, B.G; Medrano, F.J.; Barbosa, J.A.R.G.; Farah, C.S. (2006) New protein fold from Xanthomonas axonopodis pv. citri YaeQ Keystone Symposium: Frontiers in Structural Biology 29 janeiro - 3 fevereiro, Keystone, Colorado, USA.

60) Guzzo, C. R., Ribeiro L., Zucker P. J., Galvão-Botton L.P.G., Barbosa, J.A.R.G., and Farah, C.S. (2006) Purificação, Cristalização e Análise Estrutural da Proteína SufE e do domínio Hpt da RpfC de Xanthomonas axonopodis pv. citri e da GAPDH de Escherichia coli XVI Reunião Anual de Utilitários do Laboratório Nacional de Luz Síncrotron, 20-21 fevereiro, Campinas, SP.

59) Souza, D.P. Andrade, M.O, Farah, C.S. (2006) Characterization of the Interaction between two Hypothetical Proteins Related to the Chromosomal Type 4 Secretion System of Xanthomonas axonopodis pv. citri XXXV Reunião Anual de SBBq, 1-4 de julho, Águas de Lindóia, SP, Brasil.

58) Cappelletti, P.A. dos Santos Souza, T., Katsuyama, A.M., Farah, C.S. (2006) Characterization of the Protein-Protein Interaction Between HrpB2 and the HrcU C-Terminal Domain: Two Proteins of the Type III Secretion System of the Phytopathogen Xanthomonas axonopodis pathovar citri. XXXV Reunião Anual de SBBq, 1-4 de julho, Águas de Lindóia, SP, Brasil.

57) Rosa, M.C.P. and Farah, C.S. (2006) Analysis of Protein-Protein Interactions Involving RNA Polymerase Sigma Factors of Xanthomonas axonopodis pv citri. XXXV Reunião Anual de SBBq, 1-4 de julho, Águas de Lindóia, SP, Brasil.

56) Salinas, R.K., Camilo, C.M., Farah, C.S., El-Dorry, H., Chambergo, F.S. (2006) NMR Studies of a Multiprotein Bridging Factor (Trmbf1) from Trichoderma reesei, and its Interaction With TATA Binding Protein (TrtBP) XXXV Reunião Anual de SBBq, 1-4 de julho, Águas de Lindóia, SP, Brasil.

55) Marroquin-Quelopana, M., Cappelletti, P.A., Ferreira, C.B, Oliveira, J.C.F., Farah, C.S. (2006) Role of the HpaB-HpaA interaction in the secretion of HpaA by the type III secretion system of Xanthomonas axonopodis pv. citri XXXV Reunião Anual de SBBq, 1-4 de julho, Águas de Lindóia, SP, Brasil.

54) Corrêa, F., Salinas, R.K., Bonvin, A.M.J.J., Farah, C.S. (2006) Deciphering the Head-to-Tail Complex of ?-Tropomyosin using Double Mutant Cycles and Molecular Docking XXXV Reunião Anual de SBBq, 1-4 de julho, Águas de Lindóia, SP, Brasil.

53) Salinas, R.K., Ribeiro, L., Farah, C.S. (2006) NMR Studies of a Hypothetical Protein from Xanthomonas axonopodis pv. citri suggest that it could be a Transcription Regulator Involved in Quorum Sensing XXXV Reunião Anual de SBBq, 1-4 de julho, Águas de Lindóia, SP, Brasil.

52) Guzzo, C. R., Ribeiro L., Zucker P. J., Galvão-Botton L.P.G., Barbosa, J.A.R.G., and Farah, C.S. (2006) Purificação, Cristalização e Análise Estrutural da ProteínaSufE e do domínio Hpt da RpfC de Xanthomonas axonopodis pv. citri e da GAPDH de Escherichia coli. XVI Reunião Anual de Utilitários do Laboratório Nacional de Luz Síncrotron, 20-21/02/06, Campinas, SP.

51) Pertinhez, T.A. Vanini, M.M.T. Contessa, G.M. Gallo, M. Galvão-Botton, L.M. Katsuyama, A.M. Paci, M. Cicero, D.O. Farah, C.S. Benedetti C.E. and Spisni A. (2005) Using NMR for a structural proteomics study on the phytopathogen Xanthomonas axonopodis pv. citri. Structure-based investigation of the function of four unknown proteins. 2-7 July, 2005, 30th FEBS Congress, Budapest Hungary.

50) Andrade, M.O., Alegria, M.C and Farah, C.S. (2005) Characterization of protein-protein interactions important for the regulation of the quorum-sensing process in Xanthomonas axonopodis pv. citri. XXXIV Reunião Anual de SBBq, 2-5 Julho, Águas de Lindoia, SP, Brasil.

49) Rosa, M.C.P., and Farah, C.S. (2005) Analyses of protein-protein interactions involving Xanthomonas axonopodis pv citri RNA polimerase sigma factors. XXXIV Reunião Anual de SBBq, 2-5 Julho, Águas de Lindoia, SP, Brasil.

48) Corrêa , F., and Farah, C.S. (2005) An analysis of the Head-to-Tail interaction of Tropomyosin by thermodynamic cycles. XXXIV Reunião Anual de SBBq, 2-5 Julho, Águas de Lindoia, SP, Brasil.

47) Guzzo, C.R., Nagem, R.A.P., Galvão-Botton, L.M.P., Guimarães, B.G., Medrano, F.J., Barbosa, J.A.R.G., Farah, C.S. (2005) Crystalization and Structure Determination of YaeQ from Xanthomonas axonopodis pv citri. XXXIV Reunião Anual de SBBq, 2-5 Julho, Águas de Lindoia, SP, Brasil.

46) Docena, C., Alegria, MC, Khater, L., Ramos, C.H.I., Benedetti, C., Farah, C.S. (2005) Identifying new protein interactions of the virB clusters from Xanthomonas axonopodispv citri. XXXIV Reunião Anual de SBBq, 2-5 Julho, Águas de Lindoia, SP, Brasil.

45) Teixeira, E. C., Assis, P. A., Farah, C.S., Bertolini, M. C. (2005) Protein-Protein Interactions Identified for the Copper Resistance Proteins CopA, CopB and CutC from Xanthomonas axonopodis pv. citri. XXXIV Reunião Anual de SBBq, 2-5 Julho, Águas de Lindoia, SP, Brasil.

44) Paulucci, A.A. Hicks, L., Machado, A., Miranda, M.T. M., Kay, C.M. and Farah, C.S. (2003) Specific sequences determine the stability and cooperativity of folding of the C-terminal half of tropomyosin. Biophysical Society, 47th Annual Meeting, 01-05 Mar., 2003, San Antonio, EUA. Biophysical Journal.

43) Holthauzen, L.M.F. and Farah, C.S (2003) Ca2+-induced rolling of tropomyosin in muscle thin filaments: revisiting the ???-band hypothesis. Biophysical Society, 47th Annual Meeting, 01-05 Mar., 2003, San Antonio, EUA. Biophysical Journal.

42) Katsuyama, A.M.; Farah, C.S.; Galvão-Botton, L. M.P., Almeida, F.C.L.; Valente, A.P.; Spisni, A. & Pertinhez, T.A (2003) Structural genomics of phytopatogen Xanthomonas axonopodis pv. citri – NMR characterization of ApaG/CorD protein Biophysical Society, 47th Annual Meeting, 01-05 Mar., 2003, San Antonio, EUA. Biophysical Journal.

41) Guzzo, C.R. Galvão-Botton, L. Martin, F.J.M. and Farah, C.S. (2003) Purification and crystallization of three Xanthomonas axonopodis pv citri proteins for structural studies XXXII Reunião Anual de SBBq, Caxambu, M.G., Brasil.

40) E.K. Vidsiunas and C.S. Farah (2003) Strategy for determining the binding site of tropomyosin on actin, XXXII Reunião Anual de SBBq, Caxambu, M.G., Brasil.

39) M.C. Alegria,C.Docena, L.Khater, A.C.R.daSilva,C.Ramos;C.S.F arah (2003) Identification of Pathogenicity Related Proteins Interactions in the Plant Pathogen Xanthomonas axonopodis pv citri, XXXII Reunião Anual de SBBq, Caxambu, M.G., Brasil.

38) Khater, L., Alegria, M.C., Docenia, C. ,Silva, A.C.R., Farah, S. C., and Ramos, C. H. I. (2003)
Analysis of Putative Type III Secretion Chaperone Genes in Xanthomonas axonopodis pv. citri by two-hybrid system: Finding protein families to ORFans, XXXII Reunião Anual de SBBq, Caxambu, M.G., Brasil.

37) Docena, C. ; Alegria, M.C., Rosa, M.C.P, Khater, L., Ramos, C.H.I., da Silva, A.C.R. and Farah, C.S. (2003) Identifing Protein-Protein Interactions in Xanthomonas axonopodis pv citri, XXXII Reunião Anual de SBBq, Caxambu, M.G., Brasil.

36) Pinho, J.M.R.; Farah, C.S.; da Silva, A.C.R. (2003) Subsite mapping of Xanthomonas axonopodis a-amylase involved in substrate binding, XXXII Reunião Anual de SBBq, Caxambu, M.G., Brasil.

35) Holthauzen, L.M.F. and Farah, C.S. (2002) Fluorescence Quenching and Thermal denaturation of tropomyosin mutants – Implications for the regulation of muscle contraction XXXI Reunião Anual de SBBq, Caxambu, M.G., Brasil.

34) Paulucci, A.A. Hicks, L., Kay, C.M. , Machado, A., Miranda, M.T. M., Katsuyama, A.M. and Farah, C.S. (2002) Stability studies of Tropomyosin fragments and their interaction with troponin XXXI Reunião Anual de SBBq, Caxambu, M.G., Brasil.

33) Galvão-Botton L. M. P., Katsuyama, A. M. and Farah, C. S. (2002) Structural genomics of the phytopathogen Xanthomonas axonopodis pv citri XXXI Reunião Anual de SBBq, Caxambu, M.G., Brasil.

32) Katsuyama, Â. M., Sousa, A.D., Paulucci, A. A. and Farah, C. S (2002) A specific C-terminal deletion in tropomyosin results in a stronger head-to-tail interaction and increased polymerization XXXI Reunião Anual de SBBq, Caxambu, M.G., Brasil.

31) Khater, L., Santos, T.M., da Silva, A.C.R., Farah, C.S. and Ramos, C.H.I (2002) Putative type III secretion chaperone genes in the Xanthomonas axonopodis pv citri genome XXXI Reunião Anual de SBBq, Caxambu, M.G., Brasil.

30) Galvão-Botton L. M. P., Katsuyama, A. M. and Farah, C. S. (2002) Structural genomics of the phytopathogen Xanthomonas axonopodis pv citri. Keystone Symposium on Structural Genomics: From Gene Sequence to Function, 5-11 Jan., 2002, Breckenridge, CO, EUA

29) Sousa, A. D., Katsuyama, A. M., Paulucci, A.A., Vidsiunas, E.K and Farah, C.S. (2002) Investigating the tropomomyosin head-to-tail interaction using intrinsic fluorescent probes. Biophysical Society, 46th Annual Meeting, 23-27 Fev., 2002, San Francisco, EUA. Biophysical Journal.

28) Sousa, A. D. and Farah, C.S. (2001) Tropomyosin Containing Tryptophan Analogs: Probes of Specific Thin Filament Protein Interactions. Biophysical Society, 45th Annual Meeting, 17-21 Fev., 2001, Boston, EUA. Biophysical Journal 80 (1), 91a.

27) Paulucci, A.A and Farah, C.S. (2001) Stability Studies of Tropomyosin Fargments. XXX Reunião Anual de SBBq, Caxambu, M.G., Brasil.

26) Sousa, A. D. and Farah, C.S. (2001) Direct Quantitative Analysis of Tropomyosin Head-to-Tail Polymerization using an Intrinsic Fluorescence Probe. XXX Reunião Anual de SBBq, Caxambu, M.G., Brasil.

25) Holthauzen, L.M.F. and Farah, C.S. (2001) A study on the interactions among thin filament proteins using quenching of the fluorescence of tropomyosin mutants. XXX Reunião Anual de SBBq, Caxambu, M.G., Brasil.

24) Alegria, M.C. and Farah, C.S. (2001) Expression of Skeletal Muscle Myosin in Eucaryotic Cells. XXX Reunião Anual de SBBq, Caxambu, M.G., Brasil.

23) Ataide, S.F. and Farah, C.S. (2001) Modifications in the active-site of tryptophanyl-tRNA synthetase. XXX Reunião Anual de SBBq, Caxambu, M.G., Brasil.

22) Vidsiunas, E.K. and Farah, C.S (2001) Purification of 10 Tropomyosin mutants for Mapping the Interface between Tropomyosin and actin. XXX Reunião Anual de SBBq, Caxambu, M.G., Brasil.

21) Holthauzen, L.M.F., Ito, A.S. and Farah, C.S. (2000) Fluorescence Quenching Studies of Tropomyosin Mutants: Interactions with Actin and Troponin. XXIX Reunião Anual de SBBq, Caxambu, M.G., Brasil

20) Sousa, A.D. and Farah, C.S. (2000) A Tropomyosin Mutant containing an Intrinsic Fluorescent Probe may be used to Study Head-To-Tail Interaction Thermodynamics. XXIX Reunião Anual de SBBq, Caxambu, M.G., Brasil

19) Paulucci, A.A. and Farah, C.S. (2000) Tropomyosin Fragments: Stabilty and Interaction Studies with Thin Filament Proteins. XXIX Reunião Anual de SBBq, Caxambu, M.G., Brasil

18) Alegria, M.C., Bertolini, M.C. and Farah, C.S. (2000) Expression of Skeletal Muscle Myosin in the Yeast Pichia pastoris. XXIX Reunião Anual de SBBq, Caxambu, M.G., Brasil

17) Ataide, S.F. and Farah, C.S. (2000) Incorporation of 1-methyltryptophan into Recombinant Proteins. XXIX Reunião Anual de SBBq, Caxambu, M.G., Brasil

16) Martins, SM, Sousa, S.D., Fara, C.S., and Ferreira, S.T. (2000) Stability of Troponin I and T investigated by a Hydrophobic Probe XXIX Reunião Anual de SBBq, Caxambu, M.G., Brasil.

15) Holthauzen, L.M.F., Ito, A.S. and Farah, C.S. (1999) Fluorescence Quenching Studies of the Interaction of Tropomyosin with Actin and Troponin. XXVIII Reunião Anual de SBBq, Caxambu, M.G., Brasil

14) Sousa, A.D. and Farah, C.S. (1999) Mutations in a Region of Tropomyosin with an Atypical Sequence for a Coiled-coil Structure. XXVIII Reunião Anual de SBBq, Caxambu, M.G., Brasil

13) Paulucci, A.A. and Farah, C.S. (1999) Tropomyosin Fragments: Interactions with Troponin and Actin. XXVIII Reunião Anual de SBBq, Caxambu, M.G., Brasil

12) Farah, C.S., Holthauzen, L.M.F and Reinach, F.C. (1999) Ca2+-binding to troponin results in a conformational change in a region of tropomyosin outside the troponin binding site. Gordon Research Conference: Contractile Proteins, New London, N.H., USA (06-11 junho, 1999)

11) Farah, C.S. and Reinach, F.C. (1997) Ca2+-binding to Troponin Results in a Conformational Change in a Region of Tropomyosin well away from the Troponin Binding Site. International Symposium on Protein Condensation, Rio de Janeiro, Brasil.

10) Farah, C.S. and Reinach, F.C. (1997) Fluorescence and Regulatory Properties of Recombinant Tropomyosins Containing 5-Hydroxytryptophan. XXVI Reunião Anual de SBBq, Caxambu, M.G., Brasil

9) Valencia, F.F., Lee, M.F., Ramos, C.H.I., Quaggio, R.B., Farah, C.S., and Reinach, F.C. (1997) Ca2+-binding Properties of Troponin C, Troponin, and Thin Filaments using the Fluorescence of a 5-hydroxytryptphan probe in Troponin C. XXVI Reunião Anual de SBBq, Caxambu, M.G., Brasil

8) Farah, C.S. and Reinach, F.C. (1996) Fluorescence Properties of Tropomyosins containing 5-hydroxytryptophan: Probes of Thin Filament conformation, Gordon Research Conference: Contractile Proteins, New London, N.H., USA (July 27-Aug. 2, 1996)

7) Farah, C.S and Reinach, F.C. (1995) Expression of Residues 1 780 of a Skeletal Muscle Myosin Heavy Chain in E. coli, XXIV Reunião Anual de SBBq, Caxambu, M.G., Brasil

6) Ramos, C.H.I.., Farah, C.S and Reinach, F.C. (1995) Deletion Mutants of Troponin I, XXIV Reunião Anual de SBBq, Caxambu, M.G., Brasil

5) Farah, C.S., Pearlstone, J.R., Smillie, L.B. and Reinach, F.C. (1994) Fluorescence Studies of the Troponin I Troponin C Interaction, XXIII Reunião Anual de SBBq, Caxambu, M.G. Brasil

4) Ramos, C.H.I., Farah, C.S. and Reinach, F.C. (1994) Deletion Mutants of Troponin I, XXIII Reunião Anual de SBBq, Caxambu, M.G., Brasil

3) Farah, C.S., Miyamoto, C.A., Ramos, C.H.I. and Reinach, F.C. (1993) Functions of the N terminal and C terminal Domains of Troponin I, XXII Reunião Anual de SBBq, Caxambu, M.G. Brasil

2) Farah, C.S. and Reinach, F.C (1992) Construction, Bacterial Expression and Purification of Deletion Mutants of Troponin I, XXI Reunião Anual de SBBq, Caxambu, M.G. Brasil

1) Farah, C.S., Glover, J.N.M. and Pulleyblank, D.E. (1986) Single Strand Specific Endonucleases: Probes of Phosphodiester Conformation in Double Stranded DNA, Proceedings of the 5th Conversation in Biomolecular Stereodynamics, Albany, N.Y., USA

ORIENTAÇÕES EM PÓS-GRADUAÇÃO

Completadas

Nível de Doutorado:

1) Aurea Denise Sousa (bolsista de FAPESP)
Data de defesa: 08 de março de 2002
Título da tese: "Tropomiosinas contendo 5-hidroxiitriptofano: Sondas especificas para interações no filamento fino”

2) Adriana Aparecida Paulucci (bolsista de FAPESP)
Data de Defesa: 03 de outubro de 2003
Título da Tese: "Fragmentos de Tropomiosina - Estudos de Estabilidade e das Interações com TnT"

3) Luis Marcelo Fernandes Holthauzen (bolsista de FAPESP)
Data de Defesa: 29 de setembro de 2003
Título da tese: "Estudos de Estabilidade Conformaçional da Tropomiosina e de suas Interações com as Outras Proteinas do Filamento Fino”

4) Eric Kors Vidsiunas (bolsista de FAPESP)
Data de Defesa: 06 de agosto de 2004
Título da tese: “Mapeamento da Interface entre Actina e Tropomiosina”

5) Marcos Castanheira Alegria (bosista de FAPESP)
Data de Defesa: 26 de setembro de 2004
Título da tese: “Identificação e Interações Proteína-Proteína Envolvendo os Produtos dos Loci hrp, vir e hrp de Xanthomonas axonopodis pv. citri”

6) Cássia Docena (bolsista de FAPESP)
Data da defesa: 06 de outubro de 2006
Título da tese: “Identificação das Interações envolvendo proteínas relacionadas aos Sistemas de Dois-Componentes e aos Sistemas Secretórios do Tipo III e IV do Fitopatógeno Xanthomonas axonopodis pv. citri”

Nível de Mestrado:

7) Sandro Fernandes Ataide (bolsista de FAPESP)
Data da defesa: 31 agosto de 2001
Título da tese: "Modificações no Sítio Ativo da Triptofanil-tRNATrp Sintetase."

8) Maxuel Andrade (desde 03/2004, bolsa de FAPESP)
Data da defesa: 06 de julho de 2006
Título da tese: “Caracterização Bioquímica de Interações Proteína-Proteína Relacionadas com o Mecanismo de “Quorum–Sensing” do Xanthomonas axonopodis pv. citri”

Em andamento:

Nível de Doutorado:

1) Leonor Galvão de Botton (desde 07/2001, Bolsa de Fundação para a Ciência e Tecnologia do Ministério da Ciência e Tecnologia Português) “Projeto Genoma Estrutural do Fitopatógeno Xanthomonas axonopodis pv citri” Defenderá a tese entre setembro e novembro de 2007

2) Fernando Correa (desde 03/2003, bolsa de FAPESP) “Estudos da Interação Cabeça-Cauda da Tropomiosina Muscular através de Cíclos Termodinâmicos e Estudos Estruturais”

3) Paola Alejandra Cappelletti (desde 03/2004, bolsa de FAPESP) “Identificação e Análise Funcional e Estrutural de Interações Proteína-Proteína do Sistema de Secreção do Tipo III do Xanthomonas axonopodis pv citri”

4) Diorge Paulo de Souza (desde 03/2004, bolsa de CNPq) “Estudos biofísicos e Estruturais das Proteínas HrpB1, HrpD6 e o Complexo HrpB1/HrpD6 do Sistema de Secreção do Tipo III de Xanthomonas axonopodis pv. citri”

5) Maria Cláudia Pereda Rosa (desde 07/2004, bolsa de FAPESP): “Análise de Interações Proteína – Proteína Envolvendo Fatores Sigma de RNA Polimerase do Fitopatógeno Xanthomonas axonopodis pv. citri”

6) Cristiane Rodrigues Guzzo (desde 02/2005, bolsa de CNPq) “Biologia Estrutural de Proteínas de Xanthomonas axonopodis pv. citri com Possíveis Papéis em Patogenicidade.”

7) Maxuel Andrade (desde 07/2006, bolsa de FAPESP) “Caracterização Bioquímica de Interações Proteína-Proteína Relacionadas com o Mecanismo de “Quorum–Sensing” do Xanthomonas axonopodis pv. citri”

ORIENTAÇÕES DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA

Completadas
1) Cristiane Rodrigues Ruzzo (06/2002 - 02/2005, bolsa de FAPAESP) “Biologia estrutural de proteínas de Xanthomonas axonopodis pv citri com possíveis papeis em patogenicidade e sem homologia com estruturas protéicas conhecidas”
2) Taís dos Santos Souza (08/2003 - 09/2005, bolsa de PIBIC): “Expressão e cristalização de proteínas dos dos sistemas de secreção de tipo IIII e de tipo IV do Xanthomonas axonopodis pv citri”.
3) Pámela Jacqueline Zucker (12/2003 - 09/2005, bolsa de PIBIC) “Purificação e cristalização de tryptophanyl-tRNA sintetase de Xanthomonas axonopodis pv citri e desenho de mutantes para modificar sua especificidade”
4) Maria Cláudia Pereda Rosa (01/2002 - 06/2004, bolsa FAPESP): “Analíse de interações proteína – proteína envolvendo fatores sigma de RNA polimerase do fitopatógeno Xanthomonas axonopodis pv. citri”
5) Ângela Mika Katsuyama (06/2001–09/2002, bolsa de FAPESP ) “Estudos de interação cabeça-cauda da tropomiosina utilizando mutantes não-polimerizáveis e fluorescentes”
6) Aline de Jesus Barbosa (07/2002 até 07/2003)
7) Fernando Tadeu Bueno Martin (07/2002 até 01/2003)
8) Flávio Almeida Curvelo dos Anjos (02/1999 até 06/2000)
9) Fernando Itri (05/1999 até 02/2000; Bolsa PIBIC)
10) Eduardo Dutra Pastor (07/1999 até 02/2000)
11) Bruno Brito Ctenas (08/1998 até 12/1998)
12) Renato Golin (10/1997 até 03/1998)
13) Alessandra Scarlota (08/1997 até 01/1998)
14) Victor Zilberstajn (11/1996 até 11/1997)

ORIENTAÇÃO DE PÓS-DOUTORES

1) Roberto Kopke Salinas (06/2005 até 06/2007, Bolsa CAPES-ProDoc; atualmente Jovem Pesquisador de FAPESP no IQ-USP) “Estudos Estruturais das Iinterações entre BiomoléculasEnvolvendo Componentes dos Sistemas de Secreção do tipo III e IV e do Sistema Rpf de Xanthomonas axonopodis”

2) Miryam Marroquin Quelopana (03/2004 até 01/2006) “Mapeamento e Análise Funcional de Interações Proteína-Proteína do Sistema de Secreção de Tipo III (Hrp/Hrc) de Xanthomonas axonopodi pv. citri”

3) Lucicleide Ribeiro (06/2003 até 05/2005, bolsa de FAPESP 02/10335-5) “Estudos Estruturais de Proteínas do Fitopatógeno Xanthomonas axonopodis pv. citri”

ENSINO: CURSOS DE GRADUAÇÃO (IQ-USP)

2o semestre de 1996 QBQ-219 Proteínas e Metabolismo para Biologia Noturno
2o semestre de 1996 QBQ-215 Proteínas e Metabolismo para Farmácia Noturno
2o semestre de 1997 QBQ-219 Proteínas e Metabolismo para Biologia Noturno
1o semestre de 1998 QBQ-212 Biologia Molecular para Medicina Diurno
1o semestre de 1999 QBQ-211 Proteínas e Metabolismo para Medicina Diurno
1o semestre de 1999 QBQ-202 Proteínas e Metabolismo para Fisioterapia
1o semestre de 2000 QBQ-211 Proteínas e Metabolismo para Medicina Diurno
1o semestre de 2001 QBQ-211 Proteínas e Metabolismo para Medicina Diurno
2o semestre de 2002 QBQ-215 Proteínas e Metabolismo para Farmácia Noturno
2o semestre de 2003 QBQ-2456 Biologia Molecular para Química
2o semestre de 2003 QBQ-2457 Tecnologia de DNA Recombinante para Química
1o semestre de 2004 QBQ-2454 Proteínas e Metabolismo para Química Diurno
2o semestre de 2004 QBQ-215 Proteínas e Metabolismo para Farmácia Diurno
2o semestre de 2005 QBQ-220 Proteínas e Metabolismo para Biologia Noturno
2o semestre de 2005 QBQ-220 Proteínas e Metabolismo para Biologia Noturno
2o semestre de 2006 QBQ-215 Proteínas e Metabolismo para Farmácia Noturno
2o semestre de 2006 QBQ-316 Bioquímica Experimental para Farmácia Noturno
1º semestre de 2007 QBQ-3400 Proteínas e Metabolismo para o Curso de Química Noturno

ENSINO: CURSOS DE PÓS-GRADUAÇÃO (IQ-USP)

2o semestre de 1998 QBQ-5730 “Proteínas: Estrutura, Estabilidade e Interações”
2o semestre de 2000 QBQ-5730 “Proteínas: Estrutura, Estabilidade e Interações”
2o semestre de 2001 QBQ-5731 “Bioquímica Avançada I”
1o semestre de 2003 QBQ-5732 “Bioquímica Avançada II”
1o semestre de 2003 IBI-5021 “Fundamentos Básicos em Bioquímica e Biologia Molecular I”
1o semestre de 2004 IBI-5021 “Fundamentos Básicos em Bioquímica e Biologia Molecular I”
2o semestre de 2004 QBQ-5737 “A Gênese da descoberta”
1o semestre de 2005 QBQ-5732 “Bioquímica Avançada II: Mecanismos de reação e biocatálise”
2o semestre de 2005 QBQ-5737 “A Gênese da descoberta”
1º semestre de 2006 1º Curso de Inverno: Temas Avançadas de Bioquímica e Biologia Molecular - Responsável pelo Módulo de
“Cristalografia de Proteínas” (Disciplina de Cultura e Extensão oferecida a alunos de pós-graduação externos ao IQ-USP)
2o semestre de 2006 IBI-5021 “Fundamentos Básicos em Bioquímica e Biologia Molecular I”
2o semestre de 2006 QBQ-5746 “Ressonância Magnética Nuclear de Biomoléculas”
1º semestre de 2007 IBI-5021 “Fundamentos Básicos em Bioquímica e Biologia Molecular I”

BOLSAS

1) Março, 1998 - presente: Bolsa de Produtividade em Pesquisa de CNPq (atualmente Nível 1B)
2) Junho, 1994 Fev. 1996: Recém Doutor No País: CNPq processo # 300029/94 2(NV)
3) Março, 1991 Maio, 1994: Doutorado: FAPESP processo # 90/4900 2

AUXÍLIOS A PESQUISA

Em andamento

8) FAPESP processo # 05/59243-3 para Auxílio à Pesquisa – Temático (2006 até 2010)
“Análise Estrutural e Funcional de Sistemas Multiprotéicas Importantes para a Patogenicidade de Xanthomonas axonopodis pv. citri”
(coordenador: Shaker Chuck Farah, IQ-USP).

Completados

7) FAPESP processo # 00/11573-1 para Auxílio Pesquisa – Temático (2001 até 2006)
“Identificação e Análise Funcional e Estrutural das Interações Proteína-Proteína no fitopatôgeno Xanthomonas axonopodis pv citri”
(coordenador: Shaker Chuck Farah, IQ-USP).

6) FAPESP processo # 01/07534-3 para Auxílio Pesquisa (2001 até 2006) “Rede de Biologia Molecular Estrutural (SMOLBnet)”
(coordenador: Shaker Chuck Farah, IQ-USP)

5) FAPESP processo # 99/10995-0 para Auxílio Pesquisa (2000 até 2003). “Utilização de Análogos de Triptofano para Estudo de Interações de Proteínas”. (coordenador: Shaker Chuck Farah, IQ-USP)

4) PADCT processo # 02-SBIO-01/97-03/01-42 62.0460/98-1 para Auxílio Pesquisa (1998-2003). “Estabilidade e termodinâmica das proteínas regulatórias do filamento fino implicadas em quadros isquêmicos e em doenças do sarcômero”
(coordenador: Sergio T. Ferreira, UFRJ).

3) FAPESP processo # 99/07917-8 - Projeto Genoma de Xanthomonas axonopodis pv citri, (1999-2001). (coordenador: Fernando C. Reinach, IQ-USP)

2) FAPESP processo # 97/01197-8 para Auxílio Pesquisa (1997 até 1999). “Interações da Tropomiosina no Filamento Fino Muscular”.
(coordenador: Shaker Chuck Farah, IQ-USP)

1) FAPESP processo # 95/9199-4 para Auxílio Pesquisa (01-03-96 até 28-02-97).
(coordenador: Shaker Chuck Farah, IQ-USP)